Tegenwoordig is Bach niet meer weg te denken uit de muziek, maar in de jaren 1820 was zijn muziek alleen bekend als oefenboek voor studenten contrapunt. Na 1829 keerde Mendelssohn vaak terug naar Bachs muziek en hij voerde de Passie opnieuw uit in Leipzig in 1841. Nu, in het tijdperk van de Romantiek, met een symfonisch orkest en koor, herontwierp hij zowel de rol van de Evangelist als die van de solisten en verkortte hij de Passie met ongeveer 30% van zijn lengte.
Na zijn dood in 1847 lag Mendelssohns “editie” van de Passie braak bij zijn erfgenamen in Londen; zijn kleinzoon liet het uiteindelijk na aan de Bodleian Library in Oxford. Een eerste volledige reconstructie van Mendelssohns materiaal door Malcolm Bruno en Caroline Ritchie zal in december 2023 worden gepubliceerd door Bärenreiter, en de eerste opname door het Bach Choir of Bethlehem zal in maart 2024 worden uitgebracht op het label Analekta.